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Coronavirus RNA-sequenties
Sequencers hebben het genoom van het virus ondertussen al ettelijke keren totaal in kaart gebracht.
Dat gebeurt razendsnel. |
Alle wetenschappers die sequentie-analyse deden op het virus zijn het erover eens: dit virus werd niet gecreëerd in een laboratorium. Deze pisten mag verlaten worden. Het virus komt uit de natuur.
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Biochemie en eugenetica is niet mijn vakgebied, dus ik pas hier.
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Stond toch enkele weken geleden in de gazet: (beetje laat dit te melden) Citaat:
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Hopelijk is dat niet zo en zal het op een duidelijke manier ontkracht kunnen worden die denkpiste. :roll: p.s. Ik geloofde ook niet dat AIDS & EBOLA zomaar ineens ontstaan zijn. |
Citaat:
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Positief enkelstrengig RNA-virus Het genoom van een positief enkelstrengig RNA-virus kan direct dienen als messenger-RNA (mRNA) voor de codering van eiwitten (proteïne) in een gastheercel.Een gastheer? Inderdaad, virussen kunnen niet zonder gastheer. Virussen hebben geen eigen voortplantingsapparaat en geen eigen stofwisseling. |
Hoeveel landen zouden ondertussen al een of meerdere volledige sequentie-analyses doorgevoerd hebben?
Sequentie-analyse is spitstechnologie. |
Citaat:
Of heb ik gisteren weer teveel naar Maze Runner gekeken of de één of andere duistere serie die over virussen bezig zijn. :| p.s. Had het in een ander draadje ook al gepost. In deze 18 landen heeft nog niemand het coronavirus opgelopen (officieel toch niet) Raar toch dat juist Noord-Korea er géén last van heeft? :| |
Chinese auteurs publiceren in Nature:
Comparative genetic analysis of the novel coronavirus (2019-nCoV/SARS-CoV-2) receptor ACE2 in different populations |
Via sequencing kan de weg gevolgd worden die het virus aflegt. Een voorbeeld:
In northern California, for example, news reports suggest that genome sequencingChina --> Washington --> Passagiersboot 'Grand Princess' --> San Francisco |
Het genoom van het nieuwe virus bestaat uit 29.903 basen.
The genome of the Wuhan virus is 29,903 bases long, one of many clues that have led scientists to believe it is very similar to SARS. By comparing the two dozen genomes, scientists can address the “when did this start” question. The 24 available samples, including from Thailand and Shenzhen as well as Wuhan, show “very limited genetic variation,” Rambaut concluded on an online discussion forum where virologists have been sharing data and analyses. “This is indicative of a relatively recent common ancestor for all these viruses.” BRONHet genoom van het SARS virus (uitbraak 2002) bestond uit 29.727 basen. |
Virological.org was de site waar het genoom van het virus voor het eerst publiek gemaakt werd.
De vrijgave van deze informatie gebeurde op 10 januari 2020. Het genoom was vanaf dan wereldwijd beschikbaar. De informatie was afkomstig van Prof. Yong-Zhen Zhang, Fudan University, Shanghai "Please feel free to download, share, use, and analyze this data. We ask that you communicate with us if you wish to publish results that use these data in a journal. If you have any other questions –then please also contact us directly." Novel 2019 coronavirus genomeATTAAAGGTTTATACCTTCCCAGGTAACAAACCAACCAACTTTCGATCTC TTGTAGATCTGTTCTCTAAA CGAACTTTAAAATCTGTGTGGCTGTCACTCGGCTGCATGCTTAGTGCACT CACGCAGTATAATTAATAAC TAATTACTGTCGTTGACAGGACACGAGTAACTCGTCTATCTTCTGCAGGC TGCTTACGGTTTCGTCCGTG TTGCAGCCGATCATCAGCACATCTAGGTTTCGTCCGGGTGTGACCGAAAG GTAAGATGGAGAGCCTTGTC CCTGGTTTCAACGAGAAAACACACGTCCAACTCAGTTTGCCTGTTTTACA GGTTCGCGACGTGCTCGTAC GTGGCTTTGGAGACTCCGTGGAGGAGGTCTTATCAGAGGCACGTCAACAT CTTAAAGATGGCACTTGTGG CTTAGTAGAAGTTGAAAAAGGCGTTTTGCCTCAACTTGAACAGCCCTATG TGTTCATCAAACGTTCGGAT GCTCGAACTGCACCTCATGGTCATGTTATGGTTGAGCTGGTAGCAGAACT CGAAGGCATTCAGTACGGTC GTAGTGGTGAGACACTTGGTGTCCTTGTCCCTCATGTGGGCGAAATACCA GTGGCTTACCGCAAGGTTCT TCTTCGTAAGAACGGTAATAAAGGAGCTGGTGGCCATAGTTACGGCGCCG ATCTAAAGTCATTTGACTTA GGCGACGAGCTTGGCACTGATCCTTATGAAGATTTTCAAGAAAACTGGAA CACTAAACATAGCAGTGGTG TTACCCGTGAACTCATGCGTGAGCTTAACGGAGGGGCATACACTCGCTAT GTCGATAACAACTTCTGTGG CCCTGATGGCTACCCTCTTGAGTGCATTAAAGACCTTCTAGCACGTGCTG GTAAAGCTTCATGCACTTTG 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The genetic code of the coronavirus that causes COVID-19 is only about 30.000 characters long, but what a story it tells. Those nucleotides conceal secrets of the virus’ past, including its origins, its passage among families and its journey to distant ports. They signal how long it has been at large and whether it can hide by infecting people who show no outward signs of illness. And they can point the way to medicines, vaccines and public health strategies that might bring a runaway crisis under control. Unlocking all of that requires a combination of teamwork and technology that didn’t exist when the SARS epidemic broke out nearly 20 years ago. But today, when a deadly virus explodes out of nowhere, geneticists are indispensable players in the international game of whodunit. (...) |
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